Vazeni studenti,
Na tejto stranke budu ulozene vsetky dokumenty, ktore mam ako cviciaci k dispozicii. Tzn. prezentacie z cviceni, pripadne ine dokumenty,ktore budu potrebne pre Vase studium. V snahe zlepsit a multimedializovat Vase studium tu budu umiestnene aj linky na videa z youtube a odkazy na ine vzdelavacie materialy. Vela zdaru do studia.
Skúška za bakteriológie bude pozostávať zo všetkých cvičení a skrípt, teoretické aj praktické cvičenia, plus prednášky.
S pozdravom
Prednášky
- prednáška – úvod do bakteriológie 1. prednaška – bakteriologia
- prednáška – Systém 2. prednáška – Systém
- prednáška – Systém – Enterobacteriaceae 3. Enterobacteriaceae prednáška
- prenáška – Systém – G+ baktérie 4. Gram-pozitívne baktérie
- prednáška – metabolizmus baktérií 5. metabolizmu a jeho regulácia
- prednáška – identifikačné metódy 6. identifikačné metódy
1. Úvodné cvičenie
– prve cvičenie je o informáciach o predmete,poučenie o BOZP a povinnostiach,ktoré je potrebné splniť pre získanie zápočtu.
Zápočet bude udelený študentovi, ktorý získa minimálne 15 bodov zo 40 z čiastkových písomiek.
Ďalej študentovi, ktorý absolvuje cvičenia a prednášky a vymešká maximálne 3 vyučovacie jednotky.
Bodové ohodnotenie:
- čiastkové písomky 2 x 20 bodov = maximálne 40, minimálne 15
- skúška – písomná – max 60 bodov
- spolu 100 bodov
Informácie o predmete bakteriológia získate na nasledovnom linku: https://is.uniag.sk/auth/katalog/syllabus.pl?predmet=114103
2. Cvicenie – Bakteriálna bunka
Teoreticke cvicenie: Bakterialna bunka 2. cvičenie Bakteriálna bunka
Prakticke cvicenie: Izolacia bakterii z roznych zdrojov (vzorky – exkrementy osipanych, nepasterizovane mlieko, cerstva stava z ovocia a zeleniny).
Pouzite zivne media:
MRS – izolacia kyslo-mliecnych bakterii
McC (MacConkey) – Enterobacteriaceae celad
SB (Slanetz-Bartley) – enterokoki
Priprava zivneho media vratane autoklavovania s aseptickym nalievanim petriho misiek
Izolacia desiatkovym systemom riedenia vzoriek
Inokulacia zivneho media (agaru) tekutym inokulom na povrch platne
3. Cvicenie – Izolácia baktérií
Teoreticke cvicenie – Izolácia baktérií 3. cvičenie Izolácia baktérií
Prakticke cvicenie: Čistenie bakteriálnych kultúr a Gramovo farbenie
Výber vhodných kolónií
Kolónie vyberáme na základe morfologických znakov, ktoré vidíme voľným okom, makroskopické znaky:
Video – popis bakterálnych kolónií
Gramovo farbenie
postupy gramovho farbenia:
Čistenie bakteriálnych kultúr – čiarkovacia technika
Obrazová príloha – postup gramovho farbenia bez presných časov:
Rozdiely medzi Gram-pozitívnymi a Gram-negatívnymi bunkami farbenými Gramovým farbením:
Zmiešaná kultúra G+ a G- baktérií na jednom preparáte
Morfologia bakterii – mikroskopicke pozorovanie bakterialnych tvarov
Tvary baktérií
4. Cvičenie – Identifikácia baktérií 1
Identifikácia baktérií – základná identifikácia
- selektívne živné pôdy
- makroskopia a mikroskopia
- diagnostické živné pôdy
- biochemická diagnostika
Praktické cvičenie:
- farbenie bunkovej steny baktérií podľa Grama
- kultivácia na diagnostických pôdach
- Hajnov agar – základná biochemická identifikácia čeľade Enterobacteriaceae – TSI (Triple Sugar Iron agar)
dokument na stiahnutie – prezentácia z cvičenia: 4. cvičenie Identifikácia baktérií
MacConkey agar – zloženie a rozdiely skvasovania laktózy
Rast E. coli na MacConkey agare za 24hodín
Hajnov agar = TSI agar – princíp a použitie
Princíp a postup pri identifikácii pomocou Enterotestu 24 pre Enterobacteriaceae
Princíp a postup pri identifikácii pomocou Encoccus testu pre rod Enterococcus
link: https://www.erbalachema.com/attachments/EN-COCCUStest-CZ+EN+RU+SK+PL.pdf
5. Cvičenie – Identifikácia baktérií 2
Identifikácia baktérií – moderná diafnostika
- genetická identifikácia
- biochemická identifikácia – mikrosystémy (VITEK system)
- MALDI TOF MS – identifikácia hmotnostnou spektrometriou
Praktické cvičenie:
- ureázový test – test produkcie ureázy
- škrobový agar – test produkcie amylázä
- cukrová rada – test utilizácie rôznych zdrojov cukrov
dokument na stiahnutie – prezentácia z cvičenia: 5. cvičenie Identifikácia baktérií
PCR reakcia – animácia
Princíp VITEK 2 systému pri identifikácii baktérií
Identifikácia s použitím MALDI TOF MS – postup
Princíp MALDI TOF MS
6. Cvičenie – Baktérie v biotechnológiách
V cvičení č. 6 sú popísané niektoré vybrané baktérie, ktoré sa používajú v biotechnológiách.
Prezentácia: 6. cvičenie Baktérie v biotechnológiách
7. Cvičenie – Rezistencia baktérií voči antibiotikám
Prezentácia: 7. cvičenie Rezistencia baktérií na antibiotiká
K vyhodnoteniu antibiotickej rezistencie je potrebné použiť referenčné tabuľky EUCAST.org – klikni na link
Prirodzená rezistencia a špeciálne typy baktérií
Prikladám aj nejaké videá k rezistencii baktérií
Evolúcia rezistencie
Krásna ukážka rozvoja rezistencie v praxi
Prenos rezistentných génov
Bakteriálna konjugácia
Bakteriálna transformácia
Bakteriálna transdukcia
Mechanizmy rezistencie
Enzymatická deštrukcia antibiotík – Beta-laktámové antibiotiká
Makrolidová rezistencia – effluxný systém
Mechanizmy rezistencie a selekčný tlak
Metodiky testovania baktérií voči antibiotikám
Disková difúzna metóda
Stripová difúzna metóda – M.I.C.E
Pre ďalšie možnosti je potrebné hľadať v youtube: Minimal Inhibitory Concentration (MIC), Antimicrobial Susceptibility testing, Antibiotics resistance
Bakteriálna konjugácia
Bakteriálna transformácia
Bakteriálna transdukcia
Mechanizmy rezistencie
Enzymatická deštrukcia antibiotík – Beta-laktámové antibiotiká
Makrolidová rezistencia – effluxný systém
Mechanizmy rezistencie a selekčný tlak
Metodiky testovania baktérií voči antibiotikám
Disková difúzna metóda
Stripová difúzna metóda – M.I.C.E
Pre ďalšie možnosti je potrebné hľadať v youtube: Minimal Inhibitory Concentration (MIC), Antimicrobial Susceptibility testing, Antibiotics resistance
8. Cvičenie – Obligátne a fakultatívne patogény
prezentácia z cvičenia: 8. cvičenie Obligátne a fakultatívne patogény zo 4. a 5. skupiny
Prezentácia Enterobacteriaceae ako hlavnej skupiny klinicky významných baktérií: Enterobacteriaceae prednáška
Praktické cvičenie – antimikrobiálna aktivita extraktov rastlín
Prikladám videá:
Obligátne patogény
9. Cvičenie – Myxobaktérie a aktinomycéty
prezentácia z cvičenia: 9. cvičenie Myxobaktérie a aktinomycéty
Praktické cvičenie – pozorovanie aktinomycét a myxobaktérií v preparátoch
Prikladám videá:
Myxococcus xanthus a E. coli
Tvorba fruktifikačných orgánov myxobaktérií
Myxobaktérie – fyziológia
Myxococcus xanthus – formovanie fruktifikačných orgánov
10. Cvičenie – Cyanobaktérie (Sinice)
prezentácia z cvičenia: 10. cvičenie Cyanobaktérie (sinice)
Praktické cvičenie – mikroskopické pozorovanie siníc
Druhy cyanobaktérií
11. Cvičenie – Bakteriálne metabolity
prezentácia z cvičenia: 11. cvičenie Bakteriálne metabolity
12. cvičenie – Mikrobióm človeka
prezentácia z cvičenia: